進口貨物進入保稅倉庫有兩種情況：一種是直接由保稅倉庫所在地口岸入境；另一種在保稅倉庫以外的其它口岸入境。
（1）由保稅倉庫所在地口岸入境
向海關申報時，須填寫進口貨物報關單，并在報關單上加蓋保稅倉庫貨物標簽，同時注明存入××保稅倉庫，經海關查驗后始可將貨物存入保稅倉庫。
（2）由保稅倉庫以外的口岸入境
向海關申報時，需按海關進口貨物轉關運輸管理規(guī)定辦理轉關運輸手續(xù)。
其具體做法由貨物所有人先向保稅倉庫所在地主管海關提出將進口貨物轉運至保稅倉庫的申請，主管海關核實后，簽發(fā)進口貨物轉關運輸聯(lián)系單，并注明貨物轉運入××保稅倉庫。
其次，由貨物所有人持此聯(lián)系單到入境地海關辦理轉關運輸手續(xù)，入境地海關核準后，將進口貨物監(jiān)管運至保稅倉庫所在地。貨物抵達保稅倉庫后，貨物所有人依上述（1）“由保稅倉庫所在地口岸入境”之規(guī)定向主管海關辦理進口貨物申報及入庫手續(xù)。