1、保稅物流中心與境外之間的進(jìn)出貨物報(bào)關(guān)
(1)應(yīng)向物流中心主管海關(guān)辦理相關(guān)手續(xù)
(2)物流中心與境外之間進(jìn)出的貨物，不實(shí)行進(jìn)出口配額、許可證件管理
(3)從境外進(jìn)入物流中心內(nèi)的貨物，凡屬于規(guī)定存放貨物范圍內(nèi)的貨物予以保稅
(4)屬于物流中心企業(yè)進(jìn)口自用的辦公用品、交通運(yùn)輸工具、生活消費(fèi)品等以及保稅物流中心開展綜合物流服務(wù)所需進(jìn)口的機(jī)器、裝卸設(shè)備、管理設(shè)備等，按照進(jìn)口貨物的有關(guān)規(guī)定和稅收政策辦理相關(guān)手續(xù)。(不能免稅)
2、物流中心與境內(nèi)之間的進(jìn)出貨物報(bào)關(guān)
(1)出中心
①出中心進(jìn)入關(guān)境內(nèi)其他地區(qū)視同進(jìn)口。按照貨物進(jìn)入境內(nèi)的實(shí)際流向和實(shí)際狀態(tài)填制進(jìn)口貨物報(bào)關(guān)單，辦理進(jìn)口報(bào)關(guān)手續(xù)。
②出中心運(yùn)往境外填制出口貨物報(bào)關(guān)單，辦理出口報(bào)關(guān)手續(xù)。
(2)入中心
※貨物從境內(nèi)進(jìn)入物流中心視同出口，辦理出口報(bào)關(guān)手續(xù)。如需繳納出口關(guān)稅的，應(yīng)當(dāng)按照規(guī)定納稅；屬許可證件管理的商品，還應(yīng)當(dāng)向海關(guān)出具有效的出口許可證件。
※從境內(nèi)運(yùn)入保稅物流中心的原進(jìn)口貨物，境內(nèi)發(fā)貨人應(yīng)當(dāng)向海關(guān)辦理出口報(bào)關(guān)手續(xù)，經(jīng)主管海關(guān)驗(yàn)放；已經(jīng)繳納的關(guān)稅和進(jìn)口環(huán)節(jié)海關(guān)代征稅，不予退還。
※從境內(nèi)運(yùn)入物流中心已辦結(jié)報(bào)關(guān)手續(xù)的貨物，或者從境內(nèi)運(yùn)入物流中心供中心內(nèi)企業(yè)自用的國產(chǎn)設(shè)備以及轉(zhuǎn)關(guān)出口貨物，海關(guān)簽發(fā)出口退稅報(bào)關(guān)單證明聯(lián)。
※從境內(nèi)運(yùn)入物流中心的下列貨物，海關(guān)不簽發(fā)出口退稅報(bào)關(guān)單證明聯(lián)：
①供中心企業(yè)自用的生活消費(fèi)品、交通運(yùn)輸工具
②供中心企業(yè)自用的各種進(jìn)口設(shè)備
③特殊監(jiān)管區(qū)域之間往來的貨物。